サーバー OSとしてLinux(Unix)が優れている理由

結論は、WWWサーバーは
iisに比べるとApacheの方が安全である。
ApacheはUnix版の方が、Windows版に比べて最新版が出る。
したがって、Unixを使うのが安全である。

iisを使うのは論外です。セキュリティーホールの数が半端じゃありません。
WindowsでもApacheを使うことになります。
そして残念ながら、Apacheも完璧とはいえません。
Apacheにもセキュリティーホールはあります。
しかし、iisに比べると稀であり、
対策が施されるまでの速度が違います。
　しかしながら、Windows版のApacheの対策が施されるのはUnix版より後になります。
しがたがって、Unixを使うほうが、安全にサーバーを運用できるというわけです。

#補足情報
iisサーバーはダメなサーバーですが、WindowsMediaサーバーというストリーミング配信サーバーを使うときに、iis以外の選択肢がない場合があり、使用せざるを得ない場合もあります。RealからHelixという物もあるらしいですが、使われているという話を聞いたことはありません。