JavaでのWavファイルのサンプルレートの変更の仕方

Tritonusのpluginページより
http://www.tritonus.org/plugins.html
先頭
tritonus_share.jar

下側
Tritonus miscellaneous
tritonus_remaining.jar

をダウンロードしてクラスパスを通して後は、

AudioConverterのMain()を参考に呼び出す。注意点は同時に変換しないということです。
http://www.jsresources.org/examples/AudioConverter.java.html

tritonus_remaining.jarのなかに、META-INF.servicesというファイルがあり
仕組みはよく知らないのですが、自動的に登録 AudioSystemから呼びだされます。
他にも多々影響を与えますので注意が必要です。